中国农业科学院果树研究所始建于1958年3月，是我国最早建立的专门从事果树科学研究的综合性国家级科研机构。主要开展苹果、梨、葡萄等北方落叶果树的研究工作，侧重基础研究与应用基础研究，同时积极面向“三农”、面向市场，进行开发研究、科技兴农与技术服务等工作。

研究所地处风景秀美、依山傍海、交通便利的国家级旅游城市—辽宁省兴城市。经过近五十年的建设与发展，目前我所已拥有果树学博士学位授予点和果树种质资源、果树遗传育种与生物技术、果树栽培与生理、果树植物保护、果品贮藏保鲜与加工、果品质量安全等学科。建有国家苹果、梨种质资源圃、国家苹果育种中心、国家落叶果树脱毒中心、农业部果品及苗木质量监督检验测试中心等一批国家与部级研究平台以及各类配套齐全的研究分析实验室、温网室和试验场站等。形成了一支以国家级、部、院级专家领衔、中青年学术骨干为主体，学科齐全、专业素质较高的科研队伍。所内还编辑出版《中国果树》和《果树实用技术与信息》等刊物，中国园艺学会果树专业委员会设在我所。

建所以来，承担了国家及部省级科研课题400余项，取得重大科研成果150余项，为我国果树科技创新、果树产业发展与服务“三农”做出了重要贡献。